Sébastien NICOLAS
Ingénieur d'étude Biologie/Biochimie at IPBS-Toulouse (CNRS-UT3)- Claim this Profile
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Bio
Experience
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IPBS-Toulouse (CNRS-UT3)
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France
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Research Services
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1 - 100 Employee
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Ingénieur d'étude Biologie/Biochimie
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Nov 2022 - Present
Ingénieur Biologie/Biochimie au sein de l'équipe de Jérôme Nigou "Immunomodulation par les lipides et les glycoconjugués mycobactériens" à l'Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale à Toulouse. Actuellement impliqué dans un projet clinique sur la tuberculose (SMA-TB project, European Union’s Horizon 2020 funding, consortium impliquant 9 pays) visant à évaluer de nouveaux biomarqueurs prédictifs et des traitements adjuvants pour la tuberculose. Analyse quantitative d'un potentiel inflammatoire (techniques moyen-débit 96 puits) d'un grand nombre d'échantillons provenant de patients inclus en Afrique du Sud et en Géorgie. Travail de de multiples collaborations : - nouveaux prototype de collecte de condensat d'air exhalé - modulation de la réponse immunitaire de lipides mycobactériens Techniques/Compétence : gestion d'échantillons, cell-based assay, reporter-gene assay, ELISA, Dot-Blot, culture cellulaire, électrophorèse capillaire, dosage protéique, analyse lipidomique Collaborations sur des projets d'améliorations du diagnostic de la tuberculose. Show less
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l'institut du thorax
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France
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Think Tanks
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1 - 100 Employee
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Ingénieur d’étude
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Mar 2018 - Jun 2021
Employé au sein de l'équipe IIb “Insuffisance cardiaque et approches pharmacologiques” dirigé par Dr Michel DE WAARD. Missions principales : * Mise en place, optimisation et utilisation d'un nouveau système de patch-clamp à haut débit (SyncroPatch 384 PE, Nanion), * Caractérisation électrophysiologique de canaux ioniques voltage/ligand -dépendant * Screening et caractérisation de peptides naturels dérivés de venins de différentes espèces (araignée, scoprion, serpent, cône marin) * Caractérisation de nouveaux outils peptidiques dérivés: variant plus sélectif/affin, analogues fluorescents, toxines photo-activables. * Caractérisation haut-débit de variant génétique (syndrome de QT long et court, conduisant à des arythmies cardiaques). Missions transverses : * Management d'étudiants (licence et master) et référent technique de l'équipe sur les aspects de screening, culture cellulaire, cytométrie de flux et MEA. * Gestion de projet: réflexion / coordination / stratégie de publication / mise en place technique * Communication écrite : rédaction de compte-rendu, rapports, publications * Communication orale : 2 posters présentés en congrès scientifique et 1 séminaire interne Réalisations : 9 publications (1 en 1er auteur, et 1 nature communication) Show less
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Bioprojet
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France
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Pharmaceutical Manufacturing
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1 - 100 Employee
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Technicien R&D puis Ingénieur d'étude
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Sep 2009 - Mar 2018
Intégration dans l'unité de biologie/biochimie (dirigé par Dr Isabelle BERREBI-BERTRAND) du centre de recherche pharmaceutique BIOPROJET, spécialisé dans le développement pré-clinique de composés thérapeutiques dans les sphères neurologiques, gastroentérologiques et immunologiques. 5 ans >> Technicien R&D 2 ans >> Reprise d'étude en Master "innovation thérapeutique du médicament" 2 ans >> Ingénieur d'étude Missions principales : * Développement pharmaceutique dans les étapes de "drug discovery" : HTS /Hit to Lead / Lead Optimization. * Automatisation des procédés (Tecan, PerkinElmer, Hamilton). * Caractérisation pharmacologique de GPCRs cibles: intéraction ligand-recepteur, quantification d'affinité (radioligand-binding assay), activation G-proteine (GTPγS binding assay). * Etude des voies de signalisation: cAMP (CRE/MRE reporter assay), flux calcique (Fluo4 fluorescence assay), et IP1 (IP-One HTRF). * Culture cellulaire: expression de protéines recombinantes, transfection, établissement de lignée cellulaire, comptage, platting, préparation membrane cellulaire. * Evaluation de la toxicité cardiaque in-vitro : canaux ioniques exprimés et cardiomyocyte dérivés d'iPSC. * Manipulation de radioisotope, radioprotection, gestion des déchets. Missions transverses : * Communication et coordination étroite avec les unités de chimie et pharmacologie. * Amélioration continue des outils techniques (automates) et informatiques (analyse des données). * Polyvalence et autonomie dans la gestion de projets : recherche bibliographique, conception, contact fournisseur et demande de devis, mise en place et optimisation, réalisation, analyse des données, mise en forme graphique, rédaction de rapport d'études. Réalisations : * Contribution à la création d'une nouvelle base de données globale de l'entreprise * Évolution de technicien à ingénieur au travers d'une repise d'étude en Master * Devenu responsable entreprise des études de toxicité cardiaque in-vitro Show less
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College Notre dame de l'abbaye / Lycée Sacré cœur
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Nantes, Pays de la Loire, France
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Techicien de laboratoire en établissement scolaire
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Sep 2008 - Sep 2009
* Responsable des travaux pratiques scientifiques : biologie, physique, chimie, science et vie de la terre * Collaboration avec les professeurs * Gestion des équipements scientifiques et produits chimiques * Responsable des travaux pratiques scientifiques : biologie, physique, chimie, science et vie de la terre * Collaboration avec les professeurs * Gestion des équipements scientifiques et produits chimiques
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CNRS
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France
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Research Services
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700 & Above Employee
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Stage Licence professionnel : centre de lutte contre le cancer Eugène Marquis (CNRS UMR 6061)
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Jan 2008 - Jul 2008
* Sujet: Identification de marqueurs tumoraux spécifique des glioblastome multiforme en vue d'une immunothérapie active par cellule dendritiques. * Techniques: culture cellulaire, extraction/quantification ADN/ARN/protéines (Bradford, Lowry, BCA, Nanodrop), SDS-PAGE, cytométrie de flux, HPLC phase inverse. * Sujet: Identification de marqueurs tumoraux spécifique des glioblastome multiforme en vue d'une immunothérapie active par cellule dendritiques. * Techniques: culture cellulaire, extraction/quantification ADN/ARN/protéines (Bradford, Lowry, BCA, Nanodrop), SDS-PAGE, cytométrie de flux, HPLC phase inverse.
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INSERM
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France
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Research Services
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700 & Above Employee
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Stage DUT : équipe de recherche en oncologie (INSERM U601)
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Apr 2007 - Jun 2007
* Sujet: Invalidation de l'expression de gènes impliqués dans le processus de tumorigénèse des gliomes par interférence ARN. * Techniques: culture cellulaire, transfection, RT-qPCR, extraction ARN/protéines , Western-blot, cytométrie de flux, microscopie à fluorescence. * Sujet: Invalidation de l'expression de gènes impliqués dans le processus de tumorigénèse des gliomes par interférence ARN. * Techniques: culture cellulaire, transfection, RT-qPCR, extraction ARN/protéines , Western-blot, cytométrie de flux, microscopie à fluorescence.
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Education
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Université de Rennes 1
Master, Science cellulaire et moléculaire du vivant (option innovation thérapeutique du médicament) -
Université Henri Poincaré (Nancy I)
Licence professionnelle, Biologie analytique et expérimentale (option production de protéines recombinantes) -
IUT de Laval
DUT, Génie biologique (option Analyse Biologique et Biochimique) -
Lycée Jean Perrin (Rezé
Baccalauréat technologique, Sciences et Techniques de Laboratoire