Ingénieure agronome

• Oct 2020 - Present

Ingénieure agronome - Chargée d'étude

• Jan 2020 - Aug 2020

Sélectionneur des variétés de riz résistantes à la pyriculariose (Stage)

• Jan 2017 - Jun 2017

Sujet: Caractérisation de la sensibilité à la pyriculariose et de la NIS (Nitrogen induced susceptibility) au sein d’un panel de riz tempéré. Le sujet étudié l’impact de la fertilisation azoté sur la sensibilité de la plante a de nombreux pathogène fongiques dans le champ (Magnaporthe oryzae ou la pyriculariose dans ce cas). Ce phénomène appelé susceptibilité induite par l’azote (NIS). Le tâchez réalisées durant ce projet : 1. Expérimentation en condition contrôlée : > Trie des semences, préparation et réalisation des semis > Suivi quotidien des cultures : fertilisation, irrigation > Inoculation : - Culture et récolte des spores de champignon M. oryzae - Inoculation et surveille des plantes (suivi des stades de développement de champignon) > Phénotypage et sélection visuelle des variétés de riz résistantes et sensibles à la pyriculariose 2. Analyse des symptômes : Une analyse d’image a été réalisé avec l’outil EBImage sur le logiciel RStudio permet d’analyser différents traits des symptômes de la pyriculariose et être précis lors de la sélection des variétés. Cette méthode a été développée au sein de l’équipe et que j’ai optimisé durant mes travaux. 3. Analyses statistiques en utilisant le logiciel RStudio 4. Analyses génétiques : L’étude d’association génétique (GWAS) a été réalisée sous le logiciel Tassel (Trait Analysis by aSSociation, Evolutio an Linkage) 5. Taches supplémentaires : > Gérer les lots de semences et l’approvisionnement > Gérer le stock des spores de M. oryzae > Animation des réunions d’équipe Les résultats de ces travaux sont utilisés par les sélectionneurs de CFR (Centre Français du Riz) qui ont incorporé les variétés résistantes dans leurs schémas de sélection. Les résultats d’analyse génétique servent à mettre en place une sélection assistée par marqueurs.

Participation au congrès international de Printemps de Baillarguet

• May 2017 - May 2017

Présentation des travaux effectués durant le stage sur la sélection de riz résistant à la pyriculariose Présentation des travaux effectués durant le stage sur la sélection de riz résistant à la pyriculariose

Assistant de recherche en biologie moléculaire (stage)

• Apr 2016 - Sep 2016

Sujet : Etude moléculaire des étapes précoces de la symbiose azotée plante – bactérie Ce stage s’inscrit dans le projet de recherche de l’équipe SYAT à savoir l’étude du dialogue moléculaire entre la plante casuarina et la bactérie Frankia (dite symbiose actinorhizienne). Expérimentation : Culture In vitro des Casuarina et transformation génétique par « Hairy root » 1. Les plantules ont été transformées par des agrobacterium rhizogenes contenant le vecteur de transformation avec la construction ARNi-GFP 2. Sélection des plantes transformées (racines fluorescentes sous microscope en fluorescence) 3. Inoculation avec des Frankia et analyse de cinétique de nodulation Biologie moléculaire : Etude de l’efficacité de la construction ARNi par RT-PCR 1. Extraction des ARN selon le protocole RNeasy Plant Mini Kit (QIAGEN) 2. Dosage, évaluation de la qualité des ARN totaux et transcription inverse selon le protocole du Kit Superscript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR (Invitrogen). 3. Réaction de qRT-PCR Le protocole selon le 2X Brilliant II SYBR Green QPCR Master Mix (Stratagene) Microbiologie: 1. Transformation et culture bactérienne 2. Décomptage des colonies sur gel Histologie : Fixation et analyse cyto-histologique des nodules des casuarina 1. Fixation sous vide et déshydratation des nodules des casuarina 2. Inclusion dans la résine (Protocole Technovit) 3. Réalisation des coupes des nodules fixés au microtome, coloration des coupes et observation au microscope optique et confocale.

Initiation aux techniques de la biologie moléculaire

• Apr 2015 - Jun 2015

Sujet "Clonage de deux gènes de N-acétylglucosaminidases de Phaeodactylum tricornutum" Durant ce stage j’ai participé à des travaux visant à cloner et caractériser des gènes codant pour des enzymes impliquées dans la biosynthèse des N-glycannes chez une microalgue : Phaeodactylum tricornutum Les taches que j’ai réalisées durant ce stage sont : 1. Purification d’ADNg et d’ARNs à partir de cellules de P. tricornutum > Les protocoles sont définis et utilisent des kits de purification Macherey-Nagel 2. Préparation d’ADNc à partir des ARNs purifiés > Reverse-transcription selon le protocole du kit SuperScript II Reverse Transcriptase 3. Définition d’amorces pour l’amplification PCR des séquences codant les gènes étudiés à partir des ADNc ou de l’ADNg et amplification PCR > Utilisation de logiciels en ligne (Primer-Blast) pour la recherche des primers > Amplification par PCR > Contrôle de l’amplification PCR par électrophorèse en gel d’agarose et purification des produits d’amplification PCR 4. Clonage des produits d’amplification PCR dans un vecteur plasmidique et caractérisation par digestions enzymatiques et séquençage nucléotidique > Clonage : légation, transformation de cellules bactériennes, criblage de colonies de bactéries, cultures de bactéries, préparation d’ADN plasmidique > Vérification des plasmides par digestions par des enzymes de restriction et électrophorèse en gel d’agarose > Vérification des fragments clonés par séquençage nucléotidique 5. Préparation de vecteurs de transformation > Clonage des séquences codant dans un vecteur d’expression chez P. tricornutum > Transformation de cellules de P. tricornutum Ce stage m'a permis de me familiariser avec les techniques utiliser en biologie moléculaire et apprendre les bonne pratiques en laboratoire sous la supervision des chercheurs, techniciens et doctorants.

Assistante technique

• Apr 2014 - Aug 2014

Chargée d’établissement et traitement des dossiers de soumission pour projets : Possibilité d’utilisation des plantes pour la dépollution d’une ancienne usine de peinture. Chargée d’établissement et traitement des dossiers de soumission pour projets : Possibilité d’utilisation des plantes pour la dépollution d’une ancienne usine de peinture.

Ingénieure agronome en sélection des lignées d’orge résistantes à la verse

• Dec 2012 - Jul 2013

Technicienne d'expérimentation - Sélection variétale d'orge

• Dec 2012 - Jul 2013

Sélection généalogique de quelques lignées d'orge à haut rendement Sélection généalogique de quelques lignées d'orge à haut rendement