David Medina
Assistant Professor at Universidad de Magallanes- Claim this Profile
Click to upgrade to our gold package
for the full feature experience.
Topline Score
Bio
Experience
-
Universidad de Magallanes
-
Chile
-
Higher Education
-
300 - 400 Employee
-
Assistant Professor
-
Jan 2023 - Present
Como profesor asistente, brindo soporte en clases del programa de Magíster en Bioinformática y en la carrera de Ingeniería en computación, de la Universidad de Magallanes, dando los ramos relacionados con ciencia de datos. Además, de apoyar líneas de investigación bioinformática y multidisciplinarias, así como también llevar la línea de machine learning y sistemas predictivos orientados al diseño de proteínas con propiedades deseables, con foco en el diseño de métodos predictivos, la construcción de estrategias de representación y la elaboración de sistemas de diseño autónomo de proteínas. Show less
-
-
Investigador posdoctoral
-
May 2022 - Jan 2023
Como investigador postdoctoral participé en el diseño e implementación de modelos predictivos vía métodos de machine learning y arquitecturas de deep learning orientados hacia el uso en ingeniería de proteínas. Aplicando desde modelos clásicos, como arquitecturas de deep learning, también enfocándome en métodos de procesamiento de datos y de representación numérica tanto como codificación como métodos de NLP.
-
-
-
Worldalytics
-
Chile
-
Information Technology & Services
-
Data Science Researcher
-
Jul 2020 - Jan 2023
Durante mi participación en WorldAlytics, participé en diferentes proyectos de ciencia de datos y desarrollo de software. Principalmente me centré en el diseño e implementación de sistemas ETL, manejo de GCP para consultas de datos, manejo de AWS para cargas de datos y posterior consultas. Desarrollo de metodologías para el estudio de mapeo de datos y trazabilidad de datos bancarios, implementación de plataforma con geolocalización y también generé y dicté cursos de especialización orientados hacia sistemas de clustering tanto en series de tiempo como en datos no relacionales. Show less
-
-
-
Universidad de Chile
-
Chile
-
Higher Education
-
700 & Above Employee
-
Investigador
-
Mar 2017 - Jul 2022
Como investigador en la universidad de Chile, cursé mi doctorado, el cual se trató del diseño e implementación de métodos computacionales aplicados a la ingeniería de proteínas, teniendo como principal objetivo diseñar métodos de asistencia a las técnicas de diseño de proteínas vía machine learning-assisted directed evolution, o vía métodos de diseño racional. Todo con base en sistemas de machine learning, ciencia de datos y métodos de optimización. Como investigador en la universidad de Chile, cursé mi doctorado, el cual se trató del diseño e implementación de métodos computacionales aplicados a la ingeniería de proteínas, teniendo como principal objetivo diseñar métodos de asistencia a las técnicas de diseño de proteínas vía machine learning-assisted directed evolution, o vía métodos de diseño racional. Todo con base en sistemas de machine learning, ciencia de datos y métodos de optimización.
-
-
-
CeBIB - Centre for Biotechnology and Bioengineering
-
Chile
-
Research Services
-
1 - 100 Employee
-
Asistente de investigación
-
Mar 2017 - Jul 2022
Como asistente de investigación en CeBiB, participé en el diseño e implementación de DMAKit, una plataforma para acercar el machine learning a la comunidad biotec. Construí modelos predictivos aplicados a la biotecnología, participé en proyectos de modelamiento matemático relacionados con el sistema de control de glucosa-insulina, apoyé en el estudio datos biológicos obtenidos desde ensayos experimentales para comprender cambios ambientales y su efecto en organismos costeros. También participé en la construcción de una plataforma de prevención de delitos y sistemas conflictivos para la Universidad y colaboré en el modelamiento y métodos de estudio del SARS-CoV-2 Show less
-
-
-
Caltech
-
United States
-
Research Services
-
700 & Above Employee
-
Visit student research
-
Mar 2020 - Dec 2020
Durante este proceso, construí modelos de predicción de afinidad de interacción entre enzima y sustratos vía métodos de machine learning, estrategias de embedding y la utilización de natural language processing. También participé en la elaboración de una estrategia de estudios mutacionales de proteínas, contemplando tanto el efecto termodinámico como filogenético y cómo la epistasis juega un rol clave para la selección de variantes.
-
-
Visiting Research Fellow
-
Mar 2020 - Dec 2020
-
-
Education
-
Universidad de Chile
Doctor of Philosophy - PhD, Biomatemática, bioinformática y biología computacional -
Universidad de Talca
Bachelor's degree, Bioinformática