Émergeant d'un besoin du Ministère des Ressources Naturelles d'avoir un système d'assurance qualité de leurs données météorologiques, le projet prit forme en 2002. Suite à un intérêt d'Agriculture et Agroalimentaire Canada, un volet agriculture fût ajouté en 2005. En 2013, Solutions Mesonet s'incorpore comme organisme à but non lucratif ayant comme membres fondateurs Rio Tinto, Hydro-Québec et le Ministère des Forêts, de la Faune et des Parcs (MFFP). En 2015, la Financière agricole du Québec (FADQ) s'associa à l'organisation à titre de membre corporatif.
