El CIR se fundó el 12 de octubre de 1975, a iniciativa del Dr. Alberto Rosado G. Cantón, debe su nombre al ilustre "Dr. Hideyo Noguchi", quién a principios del siglo antepasado investigó en Yucatan sobre la fiebre amarilla. Recién creado como Centro de Investigaciones Biomèdicas de la UADY, inicia sus actividades en los espacios de antiguo Hospital O´Horán, quedando integrado por tres departamentos: Patología Tropical, liderado por el Dr. Jorge Zavala Velazquez; Biología de la Reproducción por la Dra. Thelma Canto Cetina y Fisiología por el Dr. Heriberto Arcila Herrera; grandes grupos de investigación que dieron origen a muchos de los grupos de trabajo aún existentes hoy en dia en el CIR.
