Continuando o seu processo de desenvolvimento estratégico, o IPS viu nascer a sua mais nova escola, na área da Saúde, criada em Março de 2000, sob despacho do Ministério das Educação. Inicia as suas actividades no ano lectivo de 2000/2001 sob a direcção da Professora Fernanda Pestana. Sendo a primeira Escola Superior de Saúde com tutela exclusiva do Ministério da Educação, a sua criação responde, também, a uma necessidade por demais referida e perfeitamente identificada da própria cidade. A escolha da enfermagem e da fisioterapia como os cursos de arranque de actividade prendeu-se com o diagnóstico realizado que apontou estas duas áreas como prioritárias, tanto a nível regional como nacional.
